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蛋白质组学和代谢组学样品制备

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蛋白质组学和代谢组学样品制备

蛋白质组学和代谢组学领域的研究人员面临着不断增加的工作量和对更快、持续周转时间准确的需求。即使是最有经验的研究人员在处理各种日常实验室任务,除了使用固相提取(SPE)方法手工准备和处理样本外,也可能造成工作流程错误。SPE通常涉及样品处理所固有的几个重复步骤,如样品制备和随机化、加载、洗涤和洗脱。这些繁琐的步骤,可能会产生工作流程出现瓶颈问题。

SPE技术通常使用注射器墨盒,这对使用1毫升或更少的小样本产生挑战。由于尺寸太大,只能同时加工少数墨盒,这导致了效率低下和操作繁琐。使用专门为蛋白质和肽SPE设计的过滤板,如Thermo‘s SOLAμ™或 Phenomenex’s Impact™ Protein Precipitation Plates,可以解决小样本量的处理限制。这些平板设计为研究人员提供了高重复性、更清洁和更稳健的样品提取,特别是对于非常小的样品和溶剂体积。但是SPE仍然需要手动执行,效率仍然是一个问题。

Aurora Biomed的VERSA 1100 SPE可以实现全自动的SPE解决方案,能解决效率和生产力的问题,不影响质量或准确性的低到中等通量的样品。VERSA 1100会自动为研究人员从头到尾的完全前期准备,腾出更多的时间来完成其他同样重要的实验室任务。

VERSA将洗涤液分配到自动化工作流程中蛋白质沉淀板及其RD模块

医院核心实验室的客户一直在使用VERSA 1100 SPE结合Phenomenex’s Impact™ 的蛋白沉淀板进行代谢组学研究。通过它提供的自动化,患者样本每月都可以在更短的时间内准备GC/MS分析,并且需要更少的人工参与。在使用VERSA 1100之前,实验室的整个样本过程都是手工完成的,平均需要6个小时来完成整个工作流程。研究人员手工进行: 1)样品标准化,从每个试管中提取等体积,2)随机化样品布局,随后将试管载入相应的点,3)使用滤板和压力装置进行清洗、洗脱和标准化步骤,4)转移采集板进行分析。VERSA 1100,整个工作流程是自动化的,并在3-4小时内完成,可以同时处理多达96个样本。

实验室技术人员将代谢组学研究的肽样品板放在VERSA的盘面上

值得注意的是,这种自动化不仅释放了更多关注其他任务的时间,而且还减少了在样本随机化步骤中的人为错误。实验室成员可以将更多的时间花在数据分析、论文撰写、手稿准备、实验室设备维护和其他必要的操作任务上。我们正在用VERSA 1100节省时间,节省的时间可以花在其他任务上,如开发新的检测方法。我们的客户说。

实验室技术员操作VERSA自动化肽纯化工作流程

简单地说,通过VERSA 1100 SPE提供的自动化样品处理解决方案,蛋白质组学和代谢组学领域的研究人员将能够最大限度地提高通量,减少分析物损失的风险,最大限度地减少人为错误,并以最小的努力产生准确、高质量的结果。

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