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磁珠混合器在VERSA下一代测序文库制备系统中应用可行性报告

磁珠混合器在VERSA下一代测序文库制备系统中应用可行性报告



by Sikander Gill, Rajwant Gill, Nick Bandy and Dong Liang

低成本高通量的便利性,使得下一代测序(NGS)应用越越广泛,例如诊断医学、传染性疾病、食品安全、卫生健康领域等。NGS似乎无所不能,但是本身也面临巨大的挑战:自动化文库制备流程的需要,以得到可靠稳定的测序结果。在NGS文库制备过程当中,磁珠在多个步骤中都有涉及,在自动化流程中扮演着不可或缺的角色,并且直接影响到基因的产量、浓度、一致性甚至文库质量,最终影响测序结果。

欧罗拉创新性磁珠混合器,基于VERSA液体工作站平台,在分配到目标位置前保持磁珠振荡混匀状态,确保磁珠均匀悬浮不沉降,最大限度减少了闭死容积,降低磁珠损耗。手动吸喷混匀磁珠,容易导致磁珠聚集,而且附着与枪头内壁,导致磁珠浪费、混匀效果不如意,若磁珠沉降较快也限制了磁珠分配时间。




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磁珠(1xPBS缓冲液)经由盘面固定的磁珠混合器振荡混匀,然后经过VERSA的自动分液,均匀分配至96孔盘,用分光光度计测定磁珠浓度。通过检测可知各微孔的磁珠浓度一致。


手动和自动化制备的NGS文库浓度,质量在可控范围内,且测序结果皮尔森相关系数r2>0.990, 无论是阳性还是阴性对照样品,结果是一致的。磁珠混合器以及VERSA自动化液体处理模块,实现了磁珠均匀悬浮以及精确分装,从而保证了最后测序结果的质量以及重现性。



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