植物样品中的核酸提取
–基于磁珠法的核酸提取
采集回来的植物样品经过研磨后进行核酸提取。提取过程采用磁珠法,该方法具有简便、高效的特点,可在液体工作站上实现完全自动控制。
2.方法原理:
植物样品在液氮低温环境下充分研磨后,与裂解液充分混合,裂解液裂解细胞壁及细胞膜使核酸暴露到细胞外。加入磁珠并充分混合使核酸与磁珠结合,适时添加磁场,从而使核酸与体系中的其他成分分离。利用清洗液清洗,去除体系中的盐、蛋白质等杂质。最后利用洗脱液将结合到磁珠上的核酸重新溶解。
3.实验
3.1试剂
3.1.1 AB 96 Magnetic Binding Plant DNA kit,包含:
MagSi Partical
Buffer SPL
Buffer SP
Buffer BW1
Buffer AE
3.1.2 需要准备:
异丙醇 400ul每个反应
80%乙醇 1.2ml每个反应
3.2 样品处理
3.2.1准备花生叶样本、研磨盘、1.5ml离心管、96深孔盘
3.2.2 1.5ml离心管中预先放入600ul buffferSPL
3.2.3 液氮环境下充分研磨花生叶,装入对应的1.5ml离心管里面,漩涡震荡20s后水浴30min
3.2.4 加入200ul bufferSP,漩涡震荡20s后冰箱放置10min
3.2.5 12000rpm离心5min,取上清
3.3 液体工作站中核酸提取过程
3.3.1 打开液体工作站电源、PC电源及软件,完成初始化,放置好2.2ml 96孔板、磁珠与试剂在相关位置
3.3.2 每反应孔加入400ul异丙醇、600ul上述上清液及15ul磁珠,震荡3min混匀,吸磁1.5min,吸弃上清液
3.3.3 加入600ul Buffer BW1,震荡1.5min混匀,吸磁40s,吸弃上清液
3.3.4 加入600ul 80%乙醇,震荡1.5min混匀,吸磁40s,吸弃上清液
3.3.5 重复3.3.7步骤一次
3.3.6 加入100ul Buffer AE,震荡1min混匀,吸磁40s,所得上清液即为核酸溶液。转移上清液至新的保存板中。
4.测试
4.1 琼脂糖凝胶配制:称量0.25g琼脂糖溶入25ml 1xTAE中,微波加热使琼脂糖完全溶解,加入1ul核酸染色剂,放入制胶模块中,插上梳子,待琼脂糖凝胶完全凝固后放入电泳仪
4.2 将核酸提取物20ul + loading buffer 3ul混合,吹打混匀,上样
4.3 将marker 5ul + loading buffer 1ul混合,吹打混匀,上样
4.4 120V恒压电泳40min,放入紫外箱中观察
5.实验结果
图1:电泳条带,最左边的泳道为marker,右边8条泳道为样品