PCR实验室一般分为三个操作区域分别为：实验室设计准备、实验室标本制备、PCR实验室扩增反应。试剂以及标本能够通过传递窗直接传送进入PCR实验室标本制备区域和PCR扩增区域。
而PCR扩增区域涉及扩增体系的构建，手动操作的配液工作容易造成误差，一般来说PCR实验室需要采用一些自动化仪器。
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