NGS(Next Generation Sequencing)是一种高通量测序技术,用于对DNA或RNA进行快速、准确的测序分析。它通过同时测序数百万到数十亿个DNA分子或RNA序列,可以在短时间内得到大量的基因组信息。
NGS技术具有高通量、高效率、低成本和多功能等特点,广泛应用于基因组学、转录组学、表观遗传学和变异检测等领域。它在疾病诊断、药物开发、农业遗传改良以及研究环境微生物群落结构等方面发挥着重要作用。
图源:J Hematol Oncol. 2017 Oct 23;10(1)167.
流程自动化
NGS测序流程主要分为样本制备、文库构建、上机测序、数据分析四个流程,NGS样品前处理的自动化可提高工作效率、减少人为错误,并确保数据的一致性和可靠性。下面是一个常见的NGS样品前处理流程自动化的示例:
- 1、样品预处理:包括DNA或RNA的提取和纯化。自动化系统可以使用酶解、磁珠或滤膜等方法,根据样品特性进行自动化纯化、浓缩和洗涤,以提高操作的一致性和效率。
- 2、文库制备:通过自动化工作站,可以实现文库构建步骤的自动化,包括适配体连接、DNA片段扩增和文库质量控制等。这样可以提高文库构建的一致性和样品处理的吞吐量。
- 3、样品索引标记:自动化系统能够在构建文库的同时添加样品索引标记,以区分不同样品之间的差异。
结论
通过自动化样品前处理流程,可以提高NGS工作的效率、减少人为错误,并确保数据的可靠性。此外,自动化系统还能够适应不同规模和需求的实验室,提供高通量、高质量的样品前处理解决方案。